O arquivo APAP integra documentação resultante das funções de administração, representação institucional, gestão financeira, formação, atividade editorial e relacionamento externo da associação, desde a sua fundação até à atualidade. Organiza-se em dois subfundos e duas séries:
- O Subarquivo CEAP (APAP-CEAP, 1968–1975) reúne 21 documentos — atas, correspondência, circulares, convocatórias, documentos financeiros e materiais programáticos — produzidos pelo Centro de Estudos de Arquitetura Paisagista, incorporados no arquivo da APAP por relação de sucessão institucional. Documenta a gestão interna do Centro, a representação de Portugal na IFLA, a organização do Curso Livre de Arquitetura Paisagista (CLAP) e a gestão financeira do Centro.
- A Série 1 — Administração (APAP-1, 1976–2022) documenta a atividade administrativa e deliberativa da APAP, através de três subséries: Assembleia Geral (APAP-1-1, 3 livros, 70 atas, 1976–2012), Direção/Comissão Diretiva (APAP-1-2, 5 livros, 1976–2009) e Tomadas de Posse dos Corpos Gerentes (APAP-1-3, 2 livros, 1982–2022).
- A Série 2 — Publicações (APAP-2, 1985–2004) reúne os fascículos das duas publicações periódicas produzidas pela APAP conservados em arquivo: a revista Arquitectura Paisagista (APAP-2-1, 3 fascículos, 1985–1987) e a revista AP (APAP-2-2, 3 fascículos, 2002–2004).
- O Subarquivo APEAP (1989–1990) é composto por um único livro de atas da Direção da Associação Portuguesa de Estudantes de Arquitetura Paisagista, com 17 atas de reuniões realizadas entre março de 1989 e outubro de 1990, incorporado no arquivo da APAP pela relação de origem e partilha de sede e recursos entre as duas entidades.